Жмешь "атаковать НЛО", корабль к ней подлетит и начнется миссия, после ее успешного окончания и прилета на базу тарелка появится в исследованиях. Сажать на корабль надо сначала пометив солдат(их имена желтыми становятся) а потом уже перетаскивать их на корабль.